به دنبال انتشار خبر اعدام شيخ نمر، ساكنان مناطق شيعه نشين عربستان و بحرين دست به تظاهرات زدند. در قطيف عربستان نيز عزاي عمومي اعلام شده است. شبكه خبري المنار لبنان نيز گزارش داد، به محض انتشار خبر اعدام شيخ نمر از سوي وزارت كشور عربستان، خودروهاي زرهي اين كشور وارد استان قطيف شده‌اند.
واكنش‌هاي بين‌المللي
حزب‌الله لبنان در بيانيه‌اي در واكنش به اقدام نظام آل سعود در اعدام شيخ نمر باقر النمر، روحاني برجسته عربستاني اعلام كرد كه اين جنايت را محكوم مي‌كند. حزب‌الله اعلام كرد: شيخ نمر خواهان احقاق حقوق تضييع شده آحاد ملتي ستم ديده بود و به همين دليل مسوولان عربستاني وي را اعدام كردند. ثبات و پايداري شيخ نمر بر حقش تا زماني كه به شهادت رسيد، باطل آل سعود را ويران و ادعاهاي آنها را تكذيب خواهد كرد. حزب‌الله از جامعه بين‌الملل و سازمان‌هاي حقوقي آن خواست تا اعدام شيخ نمر را محكوم كنند و مسوولان عربستاني را در جايي در كارنامه جنايت جهاني قرار دهند كه شايستگي آن را دارند.
در پي اعدام شيخ نمر باقر النمر از سوي مقام‌هاي عربستان، مردم بحرين در اعتراض به اين اقدام به خيابان‌ها آمدند كه با واكنش پليس بحرين روبه‌رو شده و ماموران امنيتي رژيم آل خليفه براي مقابله با آنها گاز اشك آور شليك كردند.
در پي اعدام شيخ نمر باقر النمر به همراه 46 تن ديگر از مخالفان توسط عربستان، گروه ديد‌بان حقوق بشر از اين اقدام حكومت عربستان انتقاد كرده و نحوه محاكمه شيخ نمر را ناعادلانه خواند. به گزارش آسوشيتدپرس، سارا ليا ويتسون، مدير بخش خاورميانه گروه ديد‌بان حقوق بشر در پي اعدام شدن شيخ نمر باقر النمر به همراه 46 نفر ديگر از مخالفان حكومت عربستان گفت: صرف نظر از جرايم رخ داده اينكه عربستان اقدام به اعدام گروهي از زندانيان كرده تنها موجب لكه‌دار شدن هر چه بيشتر سوابق حقوق بشري نگران‌كننده عربستان خواهد شد. اين مقام ديد‌بان حقوق بشر گفت، شيخ نمر به طرزي ناعادلانه محاكمه شده و اعدام وي تنها باعث دامن زده شدن هر چه بيشتر به ناآرامي‌ها و اختلافات فرقه‌اي موجود خواهد شد.
شوراي وحدت اسلامي پاكستان با محكوم كردن اعدام شيخ نمر اين اقدام سعودي‌ها را بي‌احترامي به احساسات ميليون‌ها مسلمان خواند و خواستار تظاهرات در محكوميت اعدام شيخ نمر شد.