نتایج ضعیف استقلال در اواخر آبان ۹۳ و اوایل آذر این سال باعث خشم طرفداران استقلال از کادر مدیریت و البته سرمربی تیم شده بود. استقلالی‌ها پس از شکست این تیم در دربی دوم آذر ۹۳ از امیر قلعه‌نویی انتقاد کردند و این انتقادات با ناکامی این تیم برابر ذوب آهن و حذف از جام حذفی در آن مقطع اوج خود رسید.
خبرورزشی هشتم آذر سال ۹۳ با اشاره به وضعیت بغرنج استقلال برای این تیم و امیر قلعه‌نویی تیتر زد: بزرگوار! نه نگو خودت برو
البته امیر قلعه‌نویی تا پایان لیگ چهاردهم در استقلال ماند ولی بعد از آن دیگر هرگز سرمربی این تیم نشد.