یکتا ناصر در ۱۲ آبان ۱۳۵۷ در تهران زاده شد. پدرش افسر بازنشسته نیروی زمینی و مادرش خانهدار است. وی در ۱۹ سالگی به واسطه علاقه به بازیگری به چند دفتر سینمایی مراجعه کرده و در تست انتخاب بازیگر شرکت نمود؛ بهطوری که در نهایت برای بازی در سریال گلهای کاغذی (۱۳۷۶) انتخاب شد


یکتا ناصر همسر منوچهر هادی کارگردان و فیلمنامهنویس سینمای ایران بوده و به گفته خود، سال ۱۴۰۱ از هم جدا شدهاند. این زوج صاحب فرزندی به نام سوفیا هستند.