متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:
بسم الله الرّحمن الرّحیم
درگذشت عالم بزرگوار جناب حجت‌الاسلام والمسلمین آقای حاج سیّدمرتضی مستجابی را به خاندان محترم و ارادتمندان و دوستان و به عموم مردم اصفهان تسلیت عرض میکنم. آن مرحوم از جمله بازماندگان خاندان شریف و اصیل صدر در عراق و ایران و علاوه بر مقامات علمی و روحانی دارای قریحه‌ی سرشار ادبی و روحیه‌ی مردمی بودند.
رحمت الهی بر وی باد.
سیّدعلی خامنه‌ای
 ۴۰۳/۱۲/۳