بعد از ناکامی استقلال در کسب عنوان قهرمانی لیگ برتر، شایعات مختلفی در مورد آینده نکونام در استقلال شنیده می‌شود.

نکونام دو سال دیگر با استقلال قرارداد دارد، ولی شنیده‌ها حاکی از آن است که مدیران هلدینگ خلیج فارس نمی‌خواهند با کادرفنی فعلی ادامه دهند. بزرگترین مشکل در راه جدایی نکونام از استقلال، مبلغ قرارداد بالای او است. نکونام با استقلال قراردادی ۳ ساله به مبلغ ۱۰۰ میلیارد تومان دارد. برای سال اول ۲۵ میلیارد، سال دوم ۳۵ میلیارد و برای سال آخر هم قرارداد نکونام با استقلال ۴۰ میلیارد تومان است.

در ابتدا گمان می‌شد اگر مدیران استقلال بخواهند نکونام را اخراج کنند، باید کل مبلغ قرارداد دو سال آینده را به او پرداخت کنند که مبلغ سنگینی می‌شود. با این حال شنیده‌ها حاکی از آن است که در قرارداد نکونام با استقلال بندی وجود دارد که در صورت عدم رضایت، مدیریت این باشگاه می‌تواند بدون پرداخت غرامت نکونام را کنار بگذارند.

بند جنجالی که به ضرر جواد خواهد شد و حالا مدیران استقلال بدون پرداخت غرامت می‌توانند دست به تغییر کادرفنی خود بزنند.