ارتش و مجمع تشخیص مصلحت نظام به سخنان اخیر پرویز فتاح رئیس بنیاد مستضعفان واکنش نشان دادند. مجمع تشخیص مصلحت نظام در بیانیه‌ای تأکید کرد: «تا زمان فوت مرحوم آقای‌ هاشمی رفسنجانی، ساختمان کاخ مرمر به عنوان دفتر رئیس فقید مجمع تشخیص مصلحت نظام مورد بهره‌برداری قرار می‌گرفت، پس از آن براساس تدابیر مقام معظم رهبری مبنی بر تمرکز امور مجمع (سازمانی و ساختمانی) به درخواست دبیر مجمع و موافقت معظم له مبنی بر انتقال مجمع به ساختمان قدیم مجلس شورای اسلامی، در مردادماه 1397 و در زمان ریاست مرحوم آیت‌الله‌ هاشمی شاهرودی بر مجمع، ساختمان کاخ مرمر تحویل ریاست وقت بنیاد مستضعفان، جناب آقای مهندس سعیدی‌کیا گردید. علاوه بر ساختمان کاخ مرمر، دو ساختمان مرکز تحقیقات استراتژیک که توسط جناب آقای دکتر روحانی و سپس جناب آقای دکتر ولایتی مدیریت می‌شد نیز در مردادماه 1397 به ریاست وقت بنیاد، جناب آقای مهندس سعیدی‌کیا تحویل شد و پس از تحویل ساختمان‌های فوق‌الذکر به بنیاد مستضعفان، مجمع تشخیص مصلحت نظام، هیچ گونه بهره‌برداری از ساختمان‌های مذکور نداشته است.» این بیانیه در پایان تأکید کرد «با عنایت به موارد مذکور، ضمن استقبال از لزوم شفافیت در امور، از مسئولان محترم انتظار می‌رود در اظهارات خود دقت لازم را معمول دارند تا باعث سوء برداشت مخاطبین نگردد.»
فتاح گفته بود مجمع تشخیص مصلحت نظام کاخ مرمر را در اختیار گرفته بود و در آن مدت، با ساخت آسانسور، استخر و جکوزی این بنای تاریخی و اثر ملی، آسیب‌های «جبران‌ناپذیر» زده است. هرچند او تاکید کرده که پس از آنکه مجمع کاخ را به ریاست جمهوری تحویل داد، حسن روحانی این مجموعه را به بنیاد بازگردانده است.
روابط عمومی پادگان کوهک نیز پیرامون اظهارات رئیس بنیاد مستضعفان در برنامه زنده «نگاه یک» درخصوص اراضی این پادگان توضیحاتی منتشر و تأکید کرد: «بر اساس مصوبات ابلاغی مقرر شده اراضی پادگان کوهک بالمناصفه بین نیروی دریایی ارتش و بنیاد مستضعفان تقسیم شود و در مسیر اجرای این مصوبه ستاد کل نیروهای مسلح به عنوان حَکم عمل خواهد کرد. بر این اساس، تمامی عواید حاصل از اعیان اراضی پادگان کوهک (ساخت و سازهای انجام شده در محدوده پادگان) متعلق به نیروی دریایی ارتش خواهد بود و بنیاد موظف به پرداخت ارزش آن به نیروی دریایی است.»
روابط عمومی پادگان کوهک ادامه داد: «پس از برگزاری جلسات متعدد در سطح نیروی دریایی ارتش و بنیاد مستضعفان و تعیین نحوه اجرای مصوبات ابلاغی از طریق به‌کارگیری کارشناسان منتخب طرفین به منظور تعیین ارزش کارشناسی روز عرصه و اعیان پادگان کوهک، کارشناس منتخب بنیاد مستضعفان، منصفانه و عادلانه عمل نکرده و موجب توقف هرگونه اقدام در پرداخت ارزش واقعی حاصل از عرصه و اعیان به نیروی دریایی ارتش شد که همین امر توقف اجرای مصوبه ابلاغی را به دنبال داشت.  برابر تدبیر ستاد کل نیروهای مسلح، مجدداً و به منظور تعیین تکلیف نهایی این اراضی، یک هیأت کارشناسی سه نفره متشکل از کارشناسان ستاد کل نیروهای مسلح، نیروی دریایی ارتش و بنیاد مستضعفان در حال بررسی و ارزش‌گذاری واقعی عرصه و اعیان پادگان کوهک هستند که به محض اعلام نظریه و مشخص شدن ارزش کارشناسی عرصه و اعیان این پادگان، مصوبات ستاد کل نیروهای مسلح اجرایی خواهد شد.» در انتهای این اطلاعیه آمده است: «شایسته است یک مقام مسئول ارشد در جایگاه رئیس محترم بنیاد مستضعفان که ایشان را فردی متشرع می‌دانیم، پیش از هرگونه اظهار نظر، مستندات خود را تکمیل و مردم و مخاطبین را به اشتباه نیندازد.» گفتنی است پیش‌تر محمود احمدی‌نژاد، بنیاد باران، معصومه ابتکار و شهیندخت مولاوردی سخنان فتاح درباره املاک دارایی بنیاد مستضعفان را رد کرده‌اند.