حضرت آیت الله مکارم شیرازی در ابتدای درس خارج فقه خود در مسجد اعظم قم، با تسلیت مجدد شهادت شیخ نمر و محکوم کردن جنایت سعودی ها، اعدام این عالم شیعه برجسته عربستان را جنایت بزرگی از سوی آل سعود دانستند و تصریح کردند: تمام دنیا این اقدام را محکوم کردند، به جز آمریکایی ها که تنها ابراز نگرانی کردند؛ تصور ما این است که این اقدام وحشتناک احتمالا با اطلاع آنها انجام شده است، آمریکایی ها و صهیونیست ها به دنبال تشدید پروژه تفرقه بین مذاهب اسلامی و شیعه و سنی هستند و از این جریان و پی آمدهای آن خوشحال اند.
معظم له با اشاره به قرار دادن نام شیخ نمر در کنار چندین تروریست و اعدام همزمان آنها، اضافه کردند: اینها به گمان خود می خواستند زرنگی کنند و اسم ایشان را در کنار برخی تروریست ها قرار دادند و با استناد به برخی آیات قرآن کریم و روایات می خواستند آدرس غلط بدهند.
معظم له اضافه کردند: شیخ نمر دست به سلاح نبرد، سلاح او قلم و زبانش بود، کاری که در گردن زدن شیخ نمر و به دار آویختن پیکر ایشان کردند دقیقا کاری بود که داعشی ها انجام می دهند؛
این اقدام حتی از سوی روزنامه های معروف غربی نیز محکوم شده و آن را دقیقاً همانند اعمال داعش دانستند.
ایشان با بیان این که سعودی ها در سیاست ها و اهداف شومی که در منطقه دارند شکست خورده اند و می خواهند انتقام بگیرند، یادآورشدند: آنها بدانند با بمباران یمن به جایی نخواهند رسید؛ اینها انتقام شکست در سوریه، یمن و عراق را می خواهند بگیرند، اما بدانند شهادت این شیخ بیگناه هزینه بزرگی که تصورش نمی کردند برای شان داشته و خواهد داشت.
حضرت آیت الله مکارم شیرازی تعرض و حمله به سفارت عربستان سعودی و کنسولگری این کشور در تهران و مشهد که از سوی برخی افراد صورت گرفت را اقدامی ناپسند دانستند و به تمام مردم و علاقه مندان و دلدادگان نظام و انقلاب توصیه کرد که دست به اقدامی نزنند که برای کشور و نظام هزینه داشته باشد.
ایشان خاطرنشان کردند: این کار می تواند از سوی دو عده انجام شود، یک عده علاقه مندان به نظام هستند که از سیاست ها و اقدامات سعودی ها به خشم امده اند، منتهی گاهی اوقات کار از دست شان در می رود و واجب است که مراقب باشند؛ گروه دوم نیز افراد نفوذی هستند که تا چنین فرصت هایی پیش می آید به دنبال ماهی گرفتن از آب گل آلود هستند و می خواهند کاری کنند که عداوت بین شیعه و سنی بیشتر شود و درگیریها گسترش یابد و به اهداف شان برسند.
ایشان اضافه کردند: نباید این کارها را انجام داد، این قبیل اقدامات هم برای نظام و هم برای اسلام هزینه های سختی دارد، وقتی دنیا در حال محکوم کردن سعودی ها هستند چرا ما کاری کنیم که ورق برگردد؛ امیدواریم دوستان بر اعصاب خود مسلط باشند و بهانه به دست دشمن ندهند و جلو نفوذی ها را به شدت بگیرند.
حضرت آیت الله مکارم شیرازی گفتند: جریان شهادت شیخ نمر چیزی نیست که به فراموشی سپرده شود، امیدواریم خدای متعال ریشه کسانی که سعی در تضعیف اسلام و قرآن دارند را برکند.