به گزارش پایگاه اطلاع رسانی شبکه خبر، آیت الله سیستانی در بیانیه ای اعدام شیخ نمر را محکوم کرده و گفت: «از شنیدن خبر اعدام تمامی برادران مومن و کسانی که خون پاکشان به ناحق و ظالمانه ریخته شده از جمله شیخ نمر النمر ابراز تاسف می کنم.»
وی رفتار سعودی ها را ظالمانه دانست و با خانواده های داغدیده گان ابراز همدردی کرد.
بسیاری از شخصیت ها و گروه های دینی، اجتماعی و سیاسی عراق پس از انتشار خبر به شهادت رساندن آیت الله نمر در زندان های سعودی به این اقدام اعتراض کردند.