امیر بازرگان از سال ۱۳۴۷ تا ۱۳۹۷ به مدت ۵۰ سال در مسیر خدمت به کشور و نیروهای مسلح فعالیت داشت و مؤسس و بنیانگذار جهاد خودکفایی در نیروهای مسلح جمهوری اسلامی ایران بود.

وی در دوران هشت سال دفاع مقدس، فرماندهی و مدیریت بیش از ۴۰۰ پروژه را برعهده داشت و در طول دوران خدمت خود به مدت ۲۰ سال معاون نیروی هوایی ارتش جمهوری اسلامی ایران بود.

معاونت وزارت دفاع در دوره وزارت شهید دریابان علی شمخانی نیز از دیگر سوابق امیر سرتیپ بازرگان به شمار می‌رود.

این پیشکسوت نیروی هوایی ارتش که از ایثارگران و جانبازان جنگ تحمیلی عراق علیه ایران بود، در طول دوران خدمت خود موفق به دریافت «نشان فتح» و «نشان دانش» شده بود.