محسن خلیلی به عنوان معاون ورزشی باشگاه پرسپولیس منصوب شد.
سرانجام باشگاه پرسپولیس تصمیم به بازگرداندن محسن خلیلی به این باشگاه گرفت تا آقای گل سرخپوشان پس از دوره موفق مدیریت آکادمی این باشگاه و همچنین یک فصل حضور در این تیم به عنوان سرپرست در کنار برانکو ایوانکوویچ، این بار در نقشی مهم به عنوان معاون ورزشی کار خود را در پرسپولیس آغاز کند.