مشکلات مالیاتی، یکی از مواردی است که همواره مشکلاتی برای دو تیم فوتبال استقلال و پرسپولیس وارد کرده است و مدیران مختلف این دو باشگاه، نسبت به انباشت مالیات و بدهی سنگین مالیاتی صحبت کرده اند.
میزان بدهی مالیات انباشته باشگاه استقلال در سال‌های اخیر به ۳۰۰ میلیارد تومان رسیده است و مدیران باشگاه پیگیر این مساله هستند. این در حالی است که باشگاه پرسپولیس هم مبلغ ۵۰۳ میلیارد تومان بدهی مالیاتی دارد.