روزنامه جمهوری اسلامی در مطلبی ادعای عجیبی درباره احمدی نژاد کرد و نوشت که رئیس جمهور سابق ایران دستور داده بود به رفسنجانی اتهام فساد بزنند.
این روزنامه نوشت: این روزها سخنان عباس پالیزدار درباره مفاسدی که توسط عده‌ای از افراد بانفوذ در نظام جمهوری اسلامی به وجود آمد، به یکی از مهم‌ترین مباحث تبدیل شده است.
آنچه در افشاگری پالیزدار از اهمیت ویژه برخوردار است، تلاشی است که برای وادار ساختن عباس پالیزدار که در دهه ۸۰ عضو هیأت تحقیق و تفحص مجلس شورای اسلامی بود صورت گرفت تا او آیت‌الله هاشمی رفسنجانی را به فساد اقتصادی متهم کند. او هم این کار را کرد ولی بعدها که پشیمان شد، درصدد عذرخواهی برآمد و از دو طریق اقدام به جبران نمودن این کار خلاف خود کرد، ارسال نامه و عذرخواهی حضوری.
شخص آیت‌الله هاشمی رفسنجانی در خاطرات ۱۳۸۸ خود به نحوه دریافت نامه عذرخواهی آقای پالیزدار که از زندان برای ایشان نوشته، اینگونه اشاره می‌کند:
مهدی خزعلی در سایت خود، نامه‌ای از پالیزدار از زندان، خطاب به من درج کرده که از من، به خاطر تهمت زدن، عذرخواهی نموده و ازعدم شکایت من، تشکر کرده.
آیت‌الله هاشمی همچنین به ملاقات حضوری و عذرخواهی آقای پالیزدار از ایشان، در خاطرات یکشنبه بیستم دی‌ماه سال ۱۳۸۸ اینگونه اشاره می‌کند:
آقای مهدی خزعلی آمد از فشارهایی که حکومت علیه او دارد شکایت کرد. آقای پالیزدار را هم، همراه خود آورده بود که از من عذرخواهی کرد.
متن نامه عذرخواهی آقای عباس پالیزدار به آقای هاشمی:
حضرت آیت‌الله هاشمی رفسنجانی دام عزه
ریاست محترم مجلس خبرگان رهبری و مجمع تشخیص مصلحت نظام
با سلام با توجه به تعبیر آن بزرگوار در نامه به رهبری به باند «پالیزدار احتراماً موارد ذیل به استحضار می‌رسد:
۱- اینجانب یک بسیجی جانباز، معتقد به انقلاب اسلامی و ولایت فقیه می‌باشم. هیچ باندی ندارم و فقط به وظیفه خود در تحقیق و تفحص مجلس عمل کرده‌ام.
۲- در ۱۲۴ پرونده مورد بررسی تحقیق و تفحص مجلس، هیچ پرونده‌ای از حضرتعالی و فرزندان شما نبود و در گزارش تحقیق و تفحص هم مدعی وجود پرونده علیه شما نشده‌ام.
۳- متأسفانه در پایان سخنرانی در دانشگاه همدان، دانشجویی از خانواده شما سؤال کرد و اینجانب بدون هیچ مستنداتی به اتکای شنیده‌های غیرمستند از نزدیکان آقای احمدی‌نژاد، مطالبی گفتم و در سخنرانی‌ها هم گفته‌ام که هیچ پرونده‌ای راجع به حضرتعالی و خانواده شما ندیده‌ام.
لذا بدین‌وسیله از محضر حضرتعالی عذرخواهی می‌کنم و امیدوارم این مختصر را به عنوان جبران بپذیرید تا باری بر دوش من در صحرای محشر نباشد.
۴- پیشاپیش از صبر و بزرگواری شما که در طول این یک سال، هیچ شکایتی از اینجانب ننموده‌اید تشکر می‌کنم، به‌رغم اینکه تنها کسی که محق بر شکایت بود شما بودید. والسلام علیکم و رحمةالله – عباس پالیزدار/ ۲۰ خرداد ۱۳۸۸.
سخنان افشاگرانه اخیر آقای عباس پالیزدار حاوی نکات متعددی است که فعلاً درصدد مطرح کردن و چرائی آن‌ها نیستم. آنچه به عنوان یک نتیجه‌گیری تاریخی بسیار مهم و پندآموز باید از این افشاگری در پرونده نظام جمهوری اسلامی به ثبت برسد اینست که در این نظام اسلامی افرادی به قدرت رسیدند که با تمام توان و امکاناتی که از بیت‌المال در اختیار داشتند درصدد تخریب بهترین، باسابقه‌ترین، انقلابی‌ترین و پاک‌ترین شخصیت‌های همین نظام برآمدند و متأسفانه مورد حمایت نیز قرار گرفتند.
از آنچه آقای پالیزدار در این زمینه گفته، همان زمان باخبر بودیم و کسانی که به او دستور داده بودند آیت‌الله هاشمی را متهم کند نیز به پاکی آیت‌الله اطمینان داشتند ولی متأسفانه برنامه این بود که این شخصیت بزرگ که شناسنامه انقلاب بود تخریب شود. در همان دوره از وزیر اطلاعات و قائم مقامش شنیدم که گفتند رئیس جمهور وقت به ما دستور داد علیه آیت‌الله هاشمی رفسنجانی اسناد و مدارک پیدا کنیم و ما هرچه گشتیم چیزی نیافتیم و این را به او گزارش دادیم و او عصبانی شد و با ما برخورد کرد.
این ماجرا نکته غمبار دیگری هم دارد که باید در پرونده نظام جمهوری اسلامی با حروف برجسته‌تر ثبت شود و آن اینست که فردی[احمدی نژاد] با این سطح نازل از اخلاق و تعهد و وجدان برای احراز مقام و منصب ریاست جمهوری این نظام که محصول خون هزاران شهید مخلص و فداکاری آنهمه انسان مؤمن پاکباز است می‌رسد.
یکی از عوارض رجل سیاسی و مذهبی دانستن چنین افرادی، محروم شدن کشور و ملت از درایت، تدبیر و تجربه انسان‌های فداکای همچون آیت‌الله هاشمی رفسنجانی بود که ظلم به نظام و کشور و ملت بود.