اوایل تابستان سال ۱۳۹۴ پس از این‌که پرویز مظلومی به عنوان سرمربی استقلال برگزیده شد و برای دومین مرتبه این سمت را احراز کرد، بحث استفاده از فرزاد و فرهاد مجیدی مطرح گردید اما این دو برادر خیلی زود به آن واکنش نشان دادند و تاکید کردند هیچ سمتی را در استقلال نمی‌پذیرند.

مظلومی در روزهای ابتدایی تیر سال ۹۴ گفته بود فرزاد مجیدی آنالیزور استقلال است و فرهاد مجیدی هم به عنوان مشاور به من کمک کرده و کنار ما خواهد بود. بلافاصله پس از این اتفاق اما فرزاد مجیدی از همکاری با سرمربی وقت استقلال انصراف داد و فرهاد هم اعلام کرد مشاور مظلومی نیست و چنین سمتی ندارد.

فرهاد در این رابطه گفت: من هیچ دخالتی در استقلال ندارم. من مشاور پرویز مظلومی نیستم و فقط به عنوان یک هوادار از استقلال حمایت می‌کنم. تفکر من و برادرم با مظلومی تفاوت دارد و در شرایط فعلی ترجیح می‌دهیم فقط هوادار استقلال باشیم. سلیقه من و فرزاد برای هدایت استقلال به گونه دیگری است. اتفاقا خودم به فرزاد گفتم از همکاری با کادر فنی استقلال انصراف بده! هرچند این انصراف به معنای دوری از استقلال نیست چون ما خانوادگی استقلالی هستیم و دلمان می‌خواهد بهترین نتایج برای این تیم رقم بخورد.

گزارش این ماجرا هفتم تیر سال ۹۴ در خبرورزشی منتشر شد و زمان خود سر و صدای زیادی به راه انداخت. البته در نهایت فرزاد تحت عنوان آنالیزور به استقلال اضافه شد و در مقطعی نیز وظیفه سرپرستی این تیم را در لیگ پانزدهم برعهده گرفت.