پرونده جاناتان پولارد جاسوسي كه در سيا كار مي‌كرد اما براي موساد اطلاعات جمع مي‌كرد، استخواني است كه سالهاست ميان روابط اسرائيل و آمريكا پابرجا مانده است. آمريكا با وجود داشتن روابط بسيار خوب و نزديك با رژيم صهيونيستي با اين حال حاضر نشد تا پولارد را در 27 سال گذشته آزاد كند. همين مساله باعث شد كه او به عنوان يكي از چالش‌هاي ميان دو دولت همچنان نقش ايفا كند. در اين وضعيت و پس از توافق هسته‌اي ميان ايرن و غرب، آمريكا حاضر شده است تا پولارد را آزاد كرده و به سرزمين اشتغالي بفرستد.

روزنامه وال‌استریت ژورنال به نقل از منابعی در دولت آمریکا نوشته است که آزادی جاناتان پولارد می تواند به ترمیم روابط تل آویو-واشنگتن کمک کند که بعد از توافق هسته ای قدرت های بزرگ با ایران صدمه دیده است. با اين حال بلافاصله بعد از انتشار اين خبر، رسانه‌هاي آمريكا به نقل از منابع آگاه در دولت اوباما هرگونه ارتباط میان بخشودگی جاناتان پولارد، متهم به جاسوسی برای اسرائیل، با توافق هسته‌ای میان ایران و پنج قدرت جهانی را رد کرده‌اند. اما همچنان ناظران سياسي و تحليلگران بر اين باورند كه اين آزادي به خاطر اهميتي كه اسرائيل براي اين فرد قائل بود مي‌تواند به بهبود روابط پس از توافق هسته‌اي كمك شايان توجهي كند. چرا كه پولارد تا آنجا براي رژيم صهيونيستي مهم بود كه به خاطر او نتانياهو حتي به زندان وي در كاروليناي شمالي رفت و با وي ملاقات كرد.

کارمند بخش اطلاعات نیروی دریایی آمریکا بود و اسرار نظامی شوروی، پاکستان، سوریه، و لیبی[۱] که سرویس های اطلاعاتی آمریکا گردآوری کرده بود را توسط یک نظامی اسرائیلی به دولت اسرائیل در ازای دریافت پول و هدایای گرانبها فاش نمود. دولت اسرائیل ماهی دو هزار و پانصد دلار پول نقد، چند حلقه الماس (که با یکی از آنها از دوست دخترش خواستگاری کرد) و هزینه هتل و رستوران پولارد را در ازای دریافت این اطلاعات پرداخت کرد. پولارد هر جمعه اطلاعات را به صورت چاپ شده که در کیف قرار داده بود به سفارت اسرائیل می برد، و در یکی از موارد در ۲۳ ژانویه ۱۹۸۵ ۵ کیف حامل اطلاعات سری را به سفارت اسرائیل تحویل داد.

اين روند دو سال بعد به دستگيري پولارد منجر شد و دادگاهي در سال 1987 او را به حبس ابد محكوم كرد و او هم‌اكنون در حال پشت ‌سر گذاشتن دوران محكوميت خود است. رژيم صهيونيستي در سال 1995 به پولارد تابعيت داد و خواستار آزادي او شد اما مديران موساد و ساير مقامات اسرائيلي تا سال 1998 حاضر به پذيرش جاسوسي پولارد براي تل‌آويو نشدند.  اين پرونده يكي از جدي‌ترين چالش‌هاي ديپلماتيك بين واشنگتن و تل‌آويو را رقم زد و نگراني‌هاي زيادي بين آمريكايي‌ها پيرامون ماهيت روابط آمريكا‌ ـ‌ اسرائيل به وجود آورد. بنيامين نتانياهو، نخست‌وزيررژيم صهيونيستي كه تاكنون چند بار در اين منصب بوده به وضوح از پولارد حمايت به عمل آورده و در چند نوبت خواستار عفو و آزادي او شده است. نتانياهو در سال 2002 با حضور در زنداني كه پولارد در آن دوران محكوميت خود را مي‌گذارند با وي ديدار كرد.