علی کفاشیان یکی از 133 رئیس فدراسیونی بود که جمعه‌شب به سپ بلاتر رأی داد. رئیس فدراسیون فوتبال ایران در مصاحبه‌ای با سایت رسمی فدراسیون فوتبال، ابتدا درباره حواشی و دستگیری اعضای فیفا در چند روز اخیر گفت: «موضوع دستگیری برخی اعضای فدراسیون جهانی فوتبال به‌دلیل مسائلی مانند حق پخش و مسائل مالی به وجود آمده بود.
 البته کاملا واضح است ایجاد چنین حواشی و دستگیری برخی اعضا، از قبل برنامه‌ریزی‌شده و هماهنگ‌شده بوده و برخی کشورهای آمریکا و اروپایی سعی داشتند با ایجاد فشار به مقاصد خود برسند و توسط رسانه‌های خود اقدام به فرافکنی و ایجاد اختلال در انتخابات کردند. 
رسانه‌هایی مانند بی‌بی‌سی و سی‌ان‌ان با این اقدام خود جو بدی برای فوتبال جهان و همین‌طور فیفا به وجود آوردند و تنها هدفشان زیر سؤال‌بردن انتخابات بود، چراکه معتقدم اگر صرفا بحث جلوگیری از فساد مطرح بود، این موضوع می‌توانست پیش از برگزاری کنگره و انتخابات فیفا یا حتی پس از آن اتفاق بیفتد، اما اینکه این اتفاق در کشور سوئیس که کشوری غیر از محل اقامت دستگیرشده‌ها است رخ داده، نشان‌دهنده اقدام ازپیش‌تعیین‌شده برخی از آنهاست». نایب‌رئیس کنفدراسیون فوتبال آسیا پس از انتخاب بلاتر درباره انتظاراتش از رئیس سوئیسی فیفا توضیح داد: «در حال حاضر فدراسیون جهانی فوتبال و شخص بلاتر باید بداند کشورهای آسیایی و آفریقایی بیشترین حمایت را از وی کردند. کشورهایی که جمعیت زیادی از جهان را به خود اختصاص داده‌اند و به‌دلیل وجود هواداران بی‌شمار و محبوبیت بالای فوتبال در آن کشورها، بلاتر باید نگرش خود را نسبت به کسانی که به وی اعتماد کردند تغییر دهد». کفاشیان تأکید کرد حالا نوبت امتیازگرفتن از فیفا در زمینه‌هایی همچون سهمیه در جام جهانی است.