تیم استقلال با برتری ۳ بر صفر مقابل الکویت کویت و ۵ بر صفر برابر الریان قطر مجوز حضور در مرحله گروهی لیگ قهرمانان آسیا را به دست آورد. شاگردان فرهاد مجیدی به این ترتیب در گروه A لیگ قهرمانان آسیا قرار گرفتند، گروهی که در آن تیم‌های الشرطه عراق، الوحده امارات و برنده دیدار پلی‌آف بین الاهلی عربستان و استقلال تاجیکستان قرار دارند.

با توجه به تصمیم کنفدراسیون فوتبال آسیا، استقلال در سه بازی رفت این گروه میهمان و در بازی‌های برگشت میزبان خواهد بود.

برنامه بازی‌های استقلال در لیگ قهرمانان آسیا:
الشرطه - استقلال، ۲۱ بهمن ۹۸
برنده دیدار استقلال تاجیکستان - الاهلی عربستان - استقلال، ۲۸ بهمن ۹۸
الوحده - استقلال، ۱۲ اسفند ۹۸
استقلال - الوحده، ۱۹ فروردین ۹۹
استقلال - الشرطه، ۲ اردیبهشت ۹۹
استقلال - برنده دیدار استقلال تاجیکستان - الاهلی عربستان، ۱۶ اردیبهشت ۹۹