پیش‌بینی سیدحسن خمینی فرزند یادگار امام درست از آب درآمد و «اعتراض» به عدم احراز صلاحیت مسیر جدیدی برای او نگشود. سیدحسن خمینی که در مرحله اول بررسی صلاحیت داوطلبان پنجمین دوره از انتخابات مجلس خبرگان رهبری از سوی شورای نگهبان تایید نشد، اعلام کرد که بعید می‌داند اعتراض به نظر شورای نگهبان مسیری جدید را بگشاید؛ چون اگر «آقایان» نتوانستند از شهادت مراجع و علما و درس‌ها و نوشته‌ها به احراز برسند، بعید است بتوانند در آینده نیز به چنین مهمی دست یابند. اکنون پیش‌بینی‌اش درست از آب درآمده و شورای نگهبان او را به دلیل اینکه «توانایی تشخیص رهبری واجد شرایط را ندارد» ردصلاحیت کرده است.
در ابتدای امر کانال تلگرامی منتسب به حسن خمینی خبر ردصلاحیت او را به نقل از یکی از نزدیکان بیت امام(ره) اعلام کرد و دلایل ردصلاحیت را اینچنین توضیح داد: «صلاحیت فرزند یادگار امام راحل به استناد بند ب ماده ۳ قانون (اجتهاد در حدی که قدرت استنباط بعضی مسائل فقهی را داشته باشد و بتواند ولی‌فقیه واجد شرایط رهبری را تشخیص دهد) احراز نشد.»
صلاحیت فرزند یادگار امام خمینی برای انتخابات مجلس خبرگان رهبری در حالی رد شده و شورای نگهبان او را ناتوان در تشخیص رهبری واجد شرایط دانسته است که بسیاری از مراجع تقلید و بزرگان حوزه علمیه قم به اجتهاد نوه بنیانگذار جمهوری اسلامی شهادت داده‌ و صلاحیت سیدحسن خمینی را محرز دانسته‌ بودند. آیات حسین وحیدخراسانی، سیدعبـدالکریـم مـوسوی‌اردبیلی، عبدالله جوادی‌آملی، سیدموسی شبیری‌زنجانی، ابراهیم امینی، سیدعلی و سیدمصطفی محقق‌داماد از جمله روحانیون بلندپایه‌ای هستند که بر اجتهاد فرزند یادگار امام مهر تایید زده بودند. با این حال مهر تایید مراجع تقلید و علمای حوزه علمیه که محمد یزدی آن را «اجازه اجتهاد در امور آخوندی» توصیف کرده بود، در موضع فقهای شورای نگهبان تاثیری نگذاشت و صلاحیت سیدحسن خمینی تایید نشد.
حتی نجات‌الله ابراهیمیان، عضو حقوقدان شورای نگهبان هم از روند بررسی صلاحیت‌ یادگار امام اطلاعی ندارد و به «ایرنا» گفته است چون هنوز شرایط نظارت استصوابی 12 عضو شورای نگهبان فراهم نشده است هیچ اطلاعی از فرآیند تایید صلاحیت‌های خبرگان ندارد. به گفته او که پیش از این سخنگوی شورای نگهبان بود در انتخابات خبرگان نیز باید مانند انتخابات مجلس شورای اسلامی بر تصمیمات 6 فقیه که جایگاهشان هیات اجرایی انتخابات مجلس خبرگان است، نظارت استصوابی باشد اما در عمل زمینه این نظارت از سوی دبیر شورای نگهبان هنوز فراهم نشده است و به همین دلیل این عضو حقوقدان شورای نگهبان هم از روند بررسی صلاحیت‌های نامزدهای خبرگان رهبری اطلاعی ندارد.