وی نامزدی در انتخابات ریاست جمهوری سال ۱۳۸۸ را کنار وزیر راه و مسکن و شهرسازی دولت حجت‌الاسلام والمسلمین حسن روحانی را در کارنامه مدیریتی خود دارد.

آخوندی امروز با حضور در ستاد انتخابات کشور برای سیزدهمین دوره انتخابات ریاست جمهوری ثبت نام کرد.

ثبت نام از داوطلبان انتخابات سیزدهمین دوره ریاست جمهوری از ساعت ۸ روز سه‌شنبه آغاز شده و تا ساعت ۱۸ امروز شنبه ۲۵ اردیبهشت ادامه دارد.