صاحب‌خبر - جعفر برزگر استقلال فصل را با شفر آغاز کرد. مرد آلمانی در لیگ هفدهم هم خوب نتیجه گرفته بود هم به‌لحاظ فوتبالی تحولی را در این تیم ایجاد کرد اما ظاهرا برای هماهنگی نفرات جدید به زمان زیادی نیاز داشت. آبی‌های پایتخت در 12 هفته فقط 16 امتیاز به‌دست آوردند و از دست دادن 20 امتیاز کافی بود تا آنها خیلی زود با صدر فاصله بگیرند. آمار گلزنی آنها در این 12 بازی خوب نبود به‌طوری که در هشت مسابقه موفق به گلزنی نشدند. البته نوسان این تیم در نتیجه‌گیری در نیم‌فصل دوم کمتر بود 11 جابه‌جایی قبل از فصل استقلالی که پا به مسابقات لیگ هجدهم گذاشت نسبت به تیم فصل گذشته‌اش تغییرات بسیاری داشت. جدایی بازیکنانی همچون جباروف، تیام، امید ابراهیمی، مجید حسینی، پادوانی (به‌دلیل مصدومیت)، سجاد شهباززاده، حسن بیت‌سعید، مجتبی جباری، یعقوب کریمی، بویان و عظیم‌گوگ باعث شد مسوولان این باشگاه برای پر کردن لیست‌شان دست به کار شوند. فرشاد محمدی‌مهر، میثم تیموری، روح‌ا... باقری، نویمایر، الحاجی گرو، مرتضی تبریزی، طارق همام، پاتوسی، گونسالوس و در ادامه هم منشا را از پرسپولیس به خدمت گرفتند اما دو بازیکن خارجی ابتدای فصل‌شان (نویمایر و الحاجی گرو) آنقدر ضعیف کار کردند که در همان نیم‌فصل عذرشان خواسته شد. بهترین خط دفاعی تاریخ لیگ استقلال با اینکه در لیگ هجدهم مقامی بهتر از سومی به‌دست نیاورد اما با دریافت 13 گل خورده صاحب بهترین خط دفاعی تاریخ لیگ برتر شد. در واقع به‌طور میانگین دروازه آنها در هر 207 دقیقه یک‌مرتبه باز شد. این آمار به‌هیچ‌وجه اتفاقی نبوده و نشان می‌دهد ساختار دفاعی آنها خوب بوده است. شاید اگر شاگردان شفر در هفته‌های نیم‌فصل اول امتیازهای باارزشی را از دست نمی‌دادند جایگاه بهتری در پایان فصل به‌دست می‌آوردند. پنج هفته طلایی شاگردان شفر در مقطعی از فصل همانی شدند که هوادارانشان انتظار داشتند. در واقع دوران کم‌نوسان آنها از هفته سیزدهم آغاز شد، به‌طوری که در پنج هفته متوالی ضمن کسب پنج پیروزی، 16 گل زدند بدون اینکه گلی دریافت کنند. استقلالی‌ها به‌ترتیب استقلال خوزستان را یک بر صفر، نفت آبادان را 3 بر صفر، سپیدرود را 5 بر صفر، پیکان را 4 بر صفر و ذوب آهن را 3 بر صفر شکست دادند. حذف مقابل سایپا استقلال در مرحله یک‌شانزدهم‌نهایی جام حذفی با تک‌گل روح‌ا... باقری در دقیقه 5+90 نفت مسجدسلیمان را در خانه‌اش شکست داد و بعد از آن به مصاف سایپا رفت. تلاش دو تیم در پایان 120 دقیقه نتیجه تساوی 2 بر 2 را به‌همراه داشت اما در ضربات پنالتی این شاگردان علی دایی بودند که حریف خود را از پیش رو برداشتند. سایپا از دو بازی‌اش مقابل استقلال در لیگ هجدهم هم صاحب چهار امتیاز شده بود. ناکام مقابل دو تیم وینفرد شفر در لیگ هجدهم موفق به شکست دو تیم نشد. شاگردان او از مهم‌ترین بازی فصل که همان دو رویارویی با پرسپولیس بود فقط یک امتیاز گرفتند. آنها مقابل پدیده هم ناکام بودند. استقلالی‌ها در تهران به تساوی رضایت دادند اما در مشهد بازی را با نتیجه یک بر صفر واگذار کردند. نیمکت‌نشینی رحمتی در متفاوت بودن دربی با بازی‌های دیگر برای دو تیم همین‌قدر بس که کوچکترین اشتباه در این مسابقه یا شکست در آن تبعاتی دارد که شاید در چند هفته گریبان تیم بازنده را بگیرد. استقلال دربی برگشت را با یک گل به پرسپولیس واگذار کرد اما شاید در همان بازی هم می‌توانست بازنده نباشد اگر فرشید اسماعیلی پنالتی‌اش را چیپ نمی‌زد، اما چیپ زدن او هم حاشیه‌های زیادی به‌همراه داشت و مدعی شدند که مهدی رحمتی به منشا گفته او پنالتی را نزند. اگرچه خودش این موضوع را تکذیب می‌کند اما اگر چیپ نمی‌زد و گل می‌زد هیچ‌وقت این حرف و حدیث‌ها به‌وجود نمی‌آمد. استقلال باخت و مهدی رحمتی بعد از آن بازی از روی نیمکت تماشاگر بازی‌های تیمش بود. آنها هفته بعد مقابل سایپا هم متوقف شدند و شرایط‌شان سخت‌تر شد. گل نخورده در 15دقیقه چهارم استقلال خیلی سخت دروازه‌اش باز می‌شد. آنها در 19 بازی گل نخوردند اما اگر می‌بینیم قهرمان یا نایب‌قهرمان نشدند به این دلیل بود که آنها در هشت مسابقه گل هم نزدند. با این حال استقلال هر اندازه که در فاز هجومی پرنوسان بود اما در کار دفاعی کم‌ایراد بودند. بازیکنان این تیم در 450 دقیقه از 2700 دقیقه‌ای که در لیگ به میدان رفتند دروازه‌شان را بسته نگه داشتند. این مهم در حد فاصل دقایق 46 تا 60 به‌دست آمد. اخراج شفر، جایگزینی مجیدی سایه سنگین باخت به پرسپولیس، حذف مقابل سایپا در جام حذفی و نتایج ضعیف در لیگ قهرمانان آسیا انتقادهای بسیاری را برای مرد آلمانی به‌همراه داشت اما آنها وقتی سپاهان را در هفته بیست‌و‌پنجم در ورزشگاه نقش‌جهان شکست دادند و بازیکنان هم مربی‌شان را مقابل چشمان امیر قلعه‌نویی به آسمان پرتاب کردند اینطور به‌نظر می‌رسید که شفر بعد از مدت‌ها نفس راحتی خواهد کشید، اما نه‌تنها اینطور نشد بلکه فقط به فاصله دو هفته و بعد از باخت به پدیده در مشهد مسوولان باشگاه استقلال خیلی زود او را برکنار و فرهاد مجیدی را به‌عنوان مربی‌شان موقت معرفی کردند. خداحافظی خسرو حیدری در لیگ هجدهم خیلی به بازی گرفته نمی‌شد و قابل پیش‌بینی هم بود که آخرین فصل فوتبالی‌اش را پشت سر می‌گذارد، همین اتفاق هم افتاد و خسرو حیدری بعد از بازی با سپیدرود در هفته پایانی لیگ از دنیای فوتبال خداحافظی کرد. داوران بازی‌های خانگی: علیرضا فغانی(4)، موعود بنیادی‌فر، سیدمهدی سیدعلی، علی صفایی(2)، حسن اکرمی، رضا کرمانشاهی، محمدحسین زاهدی‌فر، کوپال ناظمی، محمدرضا اکبریان کمک‌داوران بازی‌های خانگی: قاسمی(3)، میرزابیگی، ظهیری، اسعدی، شاهین، عیوض‌محمدی، عالیقدر(2)، نوری، غلامزاده، داوری، حاج‌محمدی، الوندی، شفیعی، ایلدروم، انتظاری، منصوری، طوری، یعقوب سخندان، عسگرمحمدی، سبحانی، نجفی، عظیم‌پور نحوه بیشترین گل‌های زده: پاس در عمق: 12تا، شوت: 7تا نحوه بیشترین گل‌های خورده: پاس در عمق: 4تا تعداد گل‌های زده در دقایق اضافه نیمه اول: صفر تعداد گل‌های زده در دقایق اضافه نیمه دوم: 3 گل تعداد گل‌های دریافتی در دقایق اضافه نیمه اول: صفر تعداد گل‌های دریافتی در دقایق اضافه نیمه دوم: یک گل تعداد تماشاگران بازی‌های خانگی: 335000نفر با احتساب نیمی از تماشاگران دو دربی تهران (80هزار نفر) حدود 335 هزار نفر برای تماشای بازی‌های استقلال به ورزشگاه رفتند که به‌طور میانگین 22333نفر برای هر بازی می‌شود. .∎​