در حکم انتصاب دکتر نیلی احمدآبادی آمده است که وی به استناد تبصره ۱ ماده ۴ آیین‌نامه جامع مدیریت دانشگاه ‌ها و مؤسسات آموزش عالی، پژوهشی و فناوری برای مدت چهار سال در ریاست دانشگاه تهران ابقا می ‌شود.

وزیر علوم در این حکم ابراز امیدواری کرده است که نیلی احمد آبادی با سعی و اهتمام و بر اساس اهداف، سیاست‌ها و برنامه های تقدیم شده به مجلس شورای اسلامی و بهره‌مندی از تجربه‌های مفید استادان، محققان و کارشناسان و جلب مشارکت دانشگاهیان و دانشجویان و هم‌فکری با سایر مسئولان دانشگاهی برای اعتلای نظام آموزش عالی کشور گام‌های مؤثری بردارد.

وزیر علوم در پایان این حکم خطاب به نیلی احمدآبادی اظهار داشته است که انتظار می‌رود با رعایت منشور اخلاقی دولت تدبیر و امید و حفظ بیت‌ المال و اعمال سیاست‌ های مؤثر صرفه‌جویی در هزینه‌ها، پرهیز از تجمل‌گرایی، تقویت نظم و انضباط و قانونمندی و ارتقای علمی، فرهنگی و اجتماعی آن دانشگاه و با اتکال به خداوند متعال نهایت کوشش و اهتمام خویش را به کار برید.